Aunque las puertas Pandora son muy similares en aspecto y función, en verdad hay notables
diferencias entre cada estructura. Primero el tamaño y segundo la composición.
Algunas de las puertas son bastante grandes, con la jaula esférica principal con un radio de más de 30 metros y un volumen de más de 100.000 metros cúbicos, con aberturas lo suficientemente grandes como para conducir un tanque o empujar un transbordador a través.
Por otro lado, la mayoría de las puertas son significativamente más pequeños, con las puertas del extremo inferior teniendo un radio de aproximadamente 2 metros de ancho y un volumen de solo alrededor de 30 metros cúbicos, solo lo suficientemente grande para que pase un transhumano individualmente.
Hay algunas especulaciones sobre que los tamaños de las puertas pueden ser programables, aunque nadie lo ha logrado todavía, o al menos no lo ha reconocido a la comunidad científica.